Museografía
El museo debe ofrecer experiencias que permitan nuevas vivencias, la producción de narrativas de múltiples lenguajes que pongan interrogantes sobre las convicciones establecidas y los discursos dominantes, planteos expositivos donde se interpele al público a una reflexión crítica, lo que supone trasferir más poder al público, desarrollando de esta manera producciones culturales desde y con las diversas miradas que se introducen.
Si bien la museología estudia en parte los procesos internos de los museos (investigación, documentación, registro y exhibición de los objetos), desde una perspectiva crítica sus alcances trascienden sus paredes, estudiando su lugar y su papel en la sociedad, sus raíces políticas, sociales y económicas así como su posible rol en la sociedad en la que se enmarca.
El objeto de estudio de la museología no está restringido sólo a los objetos per se, sino a los procesos significantes a través de los cuales los museos dotan de significado a los mismos. Tampoco está restringido a las denominadas “funciones museológicas” sino que debe abarcar a la institución y sus contextos político, social y económico, entendiendo al fenómeno museológico como un proceso que implica una construcción social histórica.
La Museologia Crítica surge de la crisis constante del concepto de museo como espacio de interacción entre el público y una colección, y como consecuencia de una política cultural. Tiene su encuadre dentro de la Teoría Crítica. Esta corriente de pensamiento plantea una nueva manera de entender la realidad, como forma de responder a las problemáticas del mundo moderno, de una manera consciente y reflexionada que aspira a la transformación de la realidad. El pensamiento crítico es autoreflexivo y autocorrectivo, evolucionando constantemente en respuesta a los contextos cambiantes en los cuales se usa. Una de sus principales características, es la continua insatisfacción con los sistemas socioeconómicos y políticos insensibles existentes y la posición excluyente de la ciencia positivista, que reclama ser la única fuente de conocimiento legítima y valida.
En este marco el museo debe interpretar las construcciones sociales y los modos en que las culturas son definidas. Repensar el rol social del museo y la cultura, implica entenderlos como espacios en los cuales puede emerger el cambio social mediante la creación de una conciencia social acerca de la situación histórica de la comunidad en la que están integrados.

Pedagogía
El área de Pedagogía tiene como eje articulador de sus actividades la búsqueda de espacios de intercambio y construcción del conocimiento entre el museo y el público en toda su diversidad. Los núcleos temáticos son abordados en consonancia con las inquietudes y problemáticas propias de la comunidad en particular y de la sociedad en general.

Botánica
El área Botánica, trabaja en conjunto con distintas instituciones y ONGs a fin de reconstruir un muestrario de ejemplares de plantas nativas y exóticas representativas de la biodiversidad regional (Herbario); a su vez, aporta contenidos favoreciendo el trabajo interdisciplinario con otras áreas, con la intención de generar diferentes actividades de extensión.
El área Botánica, trabaja en conjunto con distintas instituciones y ONG\’s a fin de reconstruir un muestrario de plantas nativas y exóticas representativas de la biodiversidad regional (Herbario).
Tres son los ejes que estructuran las líneas de trabajo y le dan sentido al mismo, estos son el Taxonómico, el Etnobotánico y el Didáctico. De esta manera, se intenta documentar todo el proceso de determinación taxonómica y de conservación del material biológico (ya sea por prensado y deshidratación o inmersión en líquidos de conservación). Las tareas de recolección, herborización, documentación, conservación, almacenamiento y el rescate de las prácticas culturales asociadas a las plantas, hacen que este patrimonio natural e histórico sea una herramienta de participación y formación comunitaria.
Simultáneamente elabora preparados histológicos, con tejidos vegetales para generar una histoteca didáctica de morfología de plantas vasculares. Cuenta a su vez, con material educativo e histórico como los modelos botánicos de yeso de Emille Deyrolle y réplicas de hongos en cera de la misma procedencia.
También aporta contenidos, favoreciendo el trabajo interdisciplinario con otras áreas a fin de generar diferentes actividades de extensión a la comunidad.
A partir del año 2013 el museo adhiere al Sistema Nacional de Datos Biológicos (SNDB), iniciativa del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva conjuntamente con el Consejo Interinstitucional de Ciencia y Tecnología (CICyT), proyecto que tiene como misión conformar una base de datos unificada de información biológica.